kegg通路分析_快速开通路网数字化服务

KEGG通路分析——快速开通路网数字化服务

KEGG (Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes) 数据库，即京都基因与基因组百科全书，是由日本京都大学生物信息学中心的Kanehisa实验室于1995年建立的，这一数据库集成了基因组、生化反应、生化物质、疾病与药物及最为常用的PATHWAY通路信息，成为了生物信息学和代谢组学领域不可或缺的资源。

KEGG的数据库构成

KEGG包含多个子库，涉及基因组信息、化学物质信息、系统信息及健康信息，KEGG PATHWAY为最核心部分，提供了大量手动绘制的通路图，涵盖代谢、遗传信息处理、环境信息处理、细胞过程、有机系统及人类疾病与药物开发等领域。

KEGG PATHWAY 数据库

KEGG PATHWAY 是最常用也是最重要的子库之一，包含了大量根据科研文献手动绘制的通路图，这些图示代表各种生物学过程，包括代谢途径、信号传导路径等，是理解生物系统高级功能的关键资源。

1. 参考通路图 (map)

定义：为原始版本，包含通用的代谢图，每个白框可代表基因、酶或反应。

功能：点击白框可链接至更详细的KO、ENZYME和REACTION信息。

2. 物种特异性通路 (org)

切换方式：在KEGG通路图中选择特定物种（如人类），通路编号会变为该物种特有的编号（如hsa00020）。

功能：显示物种特有的基因，以绿色标注。

3. 直系同源物通路 (ko)

功能：蓝色框超链接到原始版本中选取的KO条目，方便详细了解。

4. 酶通路 (ec)

功能：蓝色框链接到相应的ENZYME条目，提供酶的详细信息。

5. 反应通路 (reaction)

功能：蓝色框链接到反应条目，详细描述了生化反应过程。

四、KEGG ORTHOLOGY (KO) 数据库

KO数据库是构建Pathway和Module的基础，通过引入直系同源物（KO）概念，使得KEGG通路图、BRITE层次结构和KEGG模块的参考数据集可以广泛应用于任何细胞生物。

使用KEGG进行通路分析

进行KEGG通路分析时，可通过访问KEGG官网，通过简单的教程学习如何切换不同的通路类型，并利用丰富的在线资源进行代谢通路查询和基因功能注释，使用KEGG不仅有助于理解特定的生物学过程，还能促进疾病机制和药物开发的研究。

KEGG提供了一个全面的生物信息框架，特别在通路分析方面具有独特优势，通过深入使用KEGG PATHWAY，研究人员能够迅速获取生物过程的全面视图，从而加快科学研究和发现的步伐。

快速开通路网数字化服务

针对需要进一步深入了解KEGG通路分析的需求，可以通过官方网站提供的详细文档和帮助指南进行自学，多个生物信息学培训平台和专业课程也提供基于KEGG数据库的实用操作和解析课程，助力科研人员掌握这一宝贵的资源。

KEGG通路分析作为一种高效的数字化服务，对于生物学研究具有重要意义，能够帮助科研人员快速理解和分析生物系统的复杂性，推动生命科学领域的知识创新和技术发展。