python如何读取fasta文件

在Python中，我们可以使用Biopython库来读取fasta文件，以下是一个简单的示例：

（图片来源网络，侵删）

1、我们需要安装Biopython库，如果你还没有安装，可以使用pip进行安装：

pip install biopython

2、我们可以使用Biopython的SeqIO模块来读取fasta文件，以下是一个简单的示例：

from Bio import SeqIO
打开fasta文件
for record in SeqIO.parse("example.fasta", "fasta"):
    print("ID:", record.id)
    print("Sequence:", record.seq)

在这个示例中，我们首先导入了Biopython的SeqIO模块，我们使用SeqIO模块的parse函数来读取fasta文件，这个函数的第一个参数是文件的路径，第二个参数是文件的类型，在这个例子中，我们读取的是fasta文件。

parse函数返回一个迭代器，我们可以遍历这个迭代器来获取文件中的每一个记录，每一个记录都是一个SeqRecord对象，它包含了序列的ID和序列本身。

我们打印出了每个记录的ID和序列。

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