Aspera是一款功能强大的文件传输软件,广泛应用于生物信息学、大数据等领域,能够实现高速、稳定的数据传输,以下是关于Aspera的使用方法:
1、安装
Windows系统:从Aspera官方网站下载Aspera Connect安装程序,然后双击运行安装文件,按照提示完成安装。
Linux系统:使用wget或curl命令下载Aspera安装包,例如wget https://downloads.asperasoft.com/connect2/ibm-aspera-connect3.10.0.180973-linux-64.tar.gz
,下载完成后解压安装包,进入解压后的目录,运行./ibm-aspera-connect_3.10.0.180973-1_amd64.sh
脚本开始安装。
Mac系统:从Aspera官方网站下载Aspera Connect for IBM Cloud安装程序,双击运行安装文件,按照提示完成安装。
2、配置环境变量
Windows系统:右键点击“此电脑”,选择“属性”,在弹出的窗口中点击“高级系统设置”,在“系统属性”窗口的“高级”选项卡下,点击“环境变量”按钮,在“用户变量”或“系统变量”部分,点击“新建”按钮,分别设置变量名和值,新建变量名ASPERA_SCP_PASS,变量值为NCBI提供的aspera.openssh文件的存储地址;新建变量名Path,变量值为Aspera安装目录下的bin文件夹路径。
Linux系统:打开终端,编辑~/.bashrc文件,添加以下内容:export PATH=/path/to/aspera/bin:$PATH
(将/path/to/aspera/bin替换为Aspera实际安装目录下的bin文件夹路径),保存并关闭文件后,在终端中执行source ~/.bashrc
命令使环境变量生效。
Mac系统:类似于Linux系统,找到或创建.bash_profile或.zshrc文件(根据使用的Shell而定),在其中添加类似上述的环境变量配置语句,保存后在终端中执行source ~/.bash_profile
或source ~/.zshrc
命令。
3、数据上传
切换到Aspera的安装目录,或者确保Aspera的可执行文件所在路径已经在系统的环境变量中,使用ascp
命令进行数据上传,基本语法如下:
ascp -i /path/to/aspera.openssh -QT -l 100m -k 1 -d /path/to/local/file subasp@upload.ncbi.nlm.nih.gov:/path/to/remote/directory
-i
参数指定私钥文件的路径;-QT
表示不需要加密传输;-l 100m
设置传输带宽限制为100M;-k 1
表示启用断点续传;-d
参数用于指定本地要上传的文件或目录;subasp@upload.ncbi.nlm.nih.gov
是目标服务器地址和用户名;/path/to/remote/directory
是远程服务器上的目标目录。
4、数据下载
同样切换到Aspera的安装目录或确保环境变量设置正确,使用ascp
命令进行数据下载,基本语法如下:
ascp -i /path/to/aspera.openssh -QT -l 100m -k 1 -d /path/to/remote/file subasp@upload.ncbi.nlm.nih.gov:/path/to/local/directory
这里的参数含义与上传命令类似,只是源和目标的位置互换。
是Aspera的基本使用方法,包括安装、配置环境变量以及数据上传和下载,在使用过程中,需要根据自己的实际情况修改相应的参数和路径。
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