什么是mo域名_分子优化(MO)?

分子优化(MO)是一种通过改进现有分子结构来获得更优药效的方法,旨在发现与已知起始分子相比具有改善的药物特性的分子。

分子优化(Molecular Optimization,MO)是一种通过改进现有分子结构来获得更优药效的方法,这一过程在药物发现领域尤为重要,旨在提高药物分子的活性、选择性和安全性等关键性质。

什么是mo域名_分子优化(MO)?

基本概念与目标

分子优化的主要目标是发现与已知起始分子相比具有改善的药物特性的分子,这通常涉及对分子结构的微小调整,以期获得更好的药效,通过改变分子的某些官能团或化学键,可以显著影响其与靶标的结合亲和力和选择性。

方法与技术

近年来,机器学习已经成为分子优化的重要工具,基于机器学习的分子优化方法可以分为两大类:引导搜索和翻译,引导搜索方法利用遗传算法和贝叶斯优化等技术,在潜在表示空间中进行高效搜索,而翻译方法则将分子生成视为序列到序列的翻译问题,通过学习先导分子与改进分子之间的映射关系来实现优化。

QMO(Query-based Molecule Optimization)框架是一种新的基于查询的分子优化方法,它采用编码-解码器和外部指导,通过解耦表示学习和引导搜索来降低问题的复杂性,QMO直接在分子序列水平上进行多次预测和评估指标中引导搜索,无需进一步的拟合,QMO还采用了一种仅使用函数求值来执行高效数学优化的技术——基于零阶优化的查询引导搜索方法。

应用案例

分子优化在多个科学和工程应用中发挥着关键作用,以下是两个具体的应用案例:

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1、优化SARS-CoV-2抑制剂:为了加速针对新病毒SARS-CoV-2的药物发现,研究人员利用QMO框架优化了一组现有的SARS-CoV-2 Mpro抑制剂的亲本分子结构,通过预训练的亲和力预测器输出和谷本相似性计算,找到了满足亲和力大于阈值且谷本相似性最大的优化分子。

2、降低抗菌肽毒性:抗菌肽被认为是下一代抗生素的候选者,但设计高效的AMPs需要在多个紧密交互的属性目标之间取得平衡,研究人员使用QMO框架优化了已知的抗菌肽,以降低其毒性,通过在多个属性上进行优化,得到了毒性更低的抗菌肽变体。

表格展示

优化任务 起始分子 优化后分子 优化效果
SARS-CoV-2抑制剂优化 已知抑制剂分子 优化后的抑制剂分子 提高了亲和力和谷本相似性
抗菌肽毒性降低 已知抗菌肽 优化后的抗菌肽 降低了毒性

FAQs

Q1: 什么是分子优化(MO)?<br>

A1: 分子优化(MO)是一种通过改进现有分子结构来获得更优药效的方法,它旨在提高药物分子的活性、选择性和安全性等关键性质。

什么是mo域名_分子优化(MO)?

Q2: QMO框架是如何工作的?<br>

A2: QMO框架采用编码-解码器和外部指导,通过解耦表示学习和引导搜索来降低问题的复杂性,它直接在分子序列水平上进行多次预测和评估指标中引导搜索,并采用基于零阶优化的查询引导搜索方法来执行高效数学优化。

小编有话说

分子优化作为药物发现领域的重要环节,正随着机器学习技术的发展而不断进步,QMO等新型优化框架的出现,为解决具有约束的分子优化问题提供了有效的方法,随着更多先进技术的应用,我们有理由相信分子优化将在药物研发中发挥更加重要的作用,为人类健康事业做出更大贡献。

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