在高性能计算(HPC)领域,IB驱动自带的OpenMPI是一种重要的通信工具,它利用InfiniBand技术提供高效的数据传输能力,本文将详细介绍如何安装和使用IB驱动自带的OpenMPI,并提供相关FAQs和小编有话说部分。
一、安装和使用IB驱动自带的OpenMPI
1. 前提条件
已配置BMS集群间互相免密登录:确保所有节点之间可以通过SSH无密码登录。
已安装IB驱动:检查是否已成功安装IB驱动,可以使用以下命令查询:
ls /usr/mpi/gcc/openmpi-3.1.0rc2/bin/mpirun rpm -qa | grep mlnx-ofa
如果未安装,则需要下载并安装IB驱动。
2. 操作步骤
关闭防火墙:在集群中任意一台BMS上执行以下命令,关闭BMS防火墙。
# 关闭防火墙 systemctl stop firewalld systemctl disable firewalld
上传MySQL数据库连接驱动:如果需要连接关系型数据库,需提前手动上传驱动,对于MySQL数据库,可以从官网下载相应的JDBC驱动程序,并将其上传到目标服务器。
配置环境变量:编辑~/.bashrc
文件,添加以下内容以配置OpenMPI的环境变量:
export PATH=$PATH:/usr/mpi/gcc/openmpi-4.0.2a1/bin export LD_LIBRARY_PATH=/usr/mpi/gcc/openmpi-4.0.2a1/lib64
然后执行source ~/.bashrc
使配置生效。
运行MPI程序:在任意一台BMS中执行以下命令,检验hostfile文件是否配置成功:
mpirun -np 2 -pernode --hostfile hostfile -mca btl_openib_if_include "mlx5_0:1" -x MXM_IB_USE_GRH=y hostname
如果显示集群中所有BMS的主机名,则表示hostfile文件配置成功,可以运行MPI benchmark:
mpirun -np 2 -pernode --hostfile hostfile -mca btl_openib_if_include "mlx5_0:1" -x MXM_IB_USE_GRH=y /usr/mpi/gcc/openmpi-4.0.2a1/tests/imb/IMB-MPI1 PingPong
系统回显如图3所示,表示集群上运行IB驱动自带的OpenMPI成功。
二、常见问题解答 (FAQs)
问题1:如何确认IB驱动是否已成功安装?
答:可以通过执行以下命令来确认IB驱动是否已成功安装:
ls /usr/mpi/gcc/openmpi-3.1.0rc2/bin/mpirun rpm -qa | grep mlnx-ofa
如果回显如图1所示,表示已安装IB驱动。
问题2:如何在单台BMS上运行IB驱动自带的OpenMPI?
答:在单台BMS上运行IB驱动自带的OpenMPI,可以按照以下步骤操作:
1、确保已安装IB驱动并配置好环境变量。
2、执行以下命令运行MPI程序:
mpirun -np 2 -mca btl_openib_if_include "mlx5_0:1" -x MXM_IB_USE_GRH=y /usr/mpi/gcc/openmpi-3.1.0rc2/tests/imb/IMB-MPI1 PingPong
系统回显如图4所示,表示在单台BMS上运行Open MPI成功。
三、小编有话说
IB驱动自带的OpenMPI是高性能计算领域中的重要工具,它能够显著提升数据传输效率,在安装和使用过程中,需要注意一些细节,如确保BMS集群间的免密登录、正确配置环境变量等,通过本文的介绍,希望能够帮助大家更好地理解和使用IB驱动自带的OpenMPI,如果在实际操作中遇到问题,可以参考官方文档或寻求技术支持。
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